O efeito de uma descarga sobre um barco pode ser bem diferente de um objeto no solo. O mastro do barco é um ponto bem mais alto que sua vizinhança e, portanto, suscetível de ser atingido por um raio. Caso um raio caia no mastro, ele pode provocar aberturas no barco que podem o fazer afundar ou mesmo causar um incêndio destruindo-o completamente.

Para evitar ou ao menos diminuir a probabilidade que tal acidente ocorra, pode-se usar o mastro, caso for metálico, como um pára-raios, conectando-o a água por um cabo condutor isolado da estrutura do barco. A altura do mastro deve ser de no mínimo um quarto do comprimento do barco. O cabo deve se possível, seguir um caminho reto indo diretamente a uma placa metálica em contato direto com a água. Objetos metálicos grandes, se existirem, devem ser conectados ao cabo para evitar descargas laterais. Se o mastro não for metálico, isto é, for de madeira ou fibra, um fio de cobre de razoável espessura deve ser colocado ao longo de seu comprimento e ligado a um cabo conectado a água.

Mesmo tomando todos os cuidados acima, se estiver em um barco durante uma tempestade, procure ficar dentro da cabine (quando houver). Felizmente, os barcos são bem menos atingidos por raios do que os aviões, visto que menos raios ocorrem nos oceanos, principalmente em alto mar.