No INPE, o objetivo geral do Programa PCI é o de complementar o quadro de recursos humanos com as competências necessárias para a execução de seus programas e ações que envolvem pesquisa e desenvolvimento em tecnologias espaciais e suas aplicações, tais como: desenvolvimento e construção de satélites, cargas úteis e subsistemas espaciais; rastreio e controle de satélites; previsão de tempo e clima; sensoriamento remoto; ciências espaciais e atmosféricas; tecnologias sensíveis e programas de computador para a área espacial e suas aplicações.

Devido a complexidade e diversidade de suas atividades, o INPE possui uma estrutura que envolve uma Direção Geral e diversas Coordenações executoras dos seus Programas e Projetos. Para uma melhor sintonia com essa estrutura, o PCI/INPE está também subdividido em Áreas e Temas correspondentes às Coordenações nas quais são executadas as atividades que empregam bolsistas PCI. Cada área é contemplada com uma cota de bolsas proporcional às suas necessidades e de acordo com o Plano Diretor do INPE.